O Comitê Gestor foi instituído pelo Decreto nº 6.817-E, de 20 de dezembro de 2005 e alterado pelo Decreto nº 32.754-E, de 27 de junho de 2022. É composto pelos titulares das seguintes Secretarias de Estado e Órgãos de Administração Indireta:

• Secretaria de Estado da Agricultura, Desenvolvimento e Inovação (SEADI);
• Secretaria de Estado de Planejamento e Orçamento (SEPLAN);
• Secretaria de Estado de Infraestrutura (SEINF);
• Instituto de Terras e Colonização do Estado de Roraima (ITERAIMA);
• Fundação Estadual de Meio Ambiente e Recursos Hídricos (FEMARH);
• Procuradoria Geral do Estado de Roraima (PGE);  e
• Instituto de Assistência Técnica e Extensão Rural do Estado de Roraima (IATER).